|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
سومين کنگره ميکروبشناسي باليني ايران
از ۱۴ لغایت ۱6 مهر ماه در شیراز
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
از روزنت "ایران ما" : یك سند تاریخی- ایران ما - آنچه برای آگاهی هم وطننان ارجمند ایرانی در ذیل می آید متن ترجمه نامه عمر خلیفه دوم به یزدگرد سوم ساسانی و پاسخ یزدگرد به عمر می باشد. نسخه اصلی این نامه ها در موزه لندن نگهداری می شود. زمان نگاشته شدن این نامه ها مربوط می شود به پس از جنگ قادسیه و پیش از جنگ نهاوند که حدوداً چهار ماه به طول انجامید . از عمر بن الخطاب خلیفه مسلمین به یزدگرد سوم شاهنشاه پارس یزدگرد، من آینده روشنی برای تو و ملت تو نمی بینم مگر اینکه پیشنهاد مرا بپذیری و با من بیعت کنی. تو سابقا بر نصف جهان حکم می راندی ولی اکنون که سپاهیان تو در خطوط مقدم شکست خورده اند و ملت تو در حال فروپاشی است. من به تو راهی را پیشنهاد می کنم تا جانت را نجات دهی. شروع کن به پرستش خدای واحد، به یکتا پرستی، به عبادت خدای یکتا که همه چیزرا او آفریده. ما برای تو و برای تمام جهان پیام او را آورده ایم، او که خدای راستین است. از پرستش آتش دست بردار و به ملت خود فرمان بده که آنها نیز از پرستش آتش که خطاست دست بکشند، بما بپیوند الله اکبر را پرستش کن که خدای راستین است و خالق جهان. الله را عبادت کن و اسلام را بعنوان راه رستگاری بپذیر. به راه کفر آمیز خود پایان بده و اسلام بیاور و الله اکبر را منجی خود بدان. با این کار زندگی خودت را نجات بده و صلح را برای پارسیان بدست آر. اگر بهترین انتخاب را می خواهی برای عجم ها ( لقبی که عربها به پارسیان می دادند بعمنی کودن و لال) انجام دهی با من بیعت کن.الله اکبر خلیفه مسلمین عمربن الخطاب -------------------- نامه یزدگرد : از شاه شاهان، شاه پارس، شاه سرزمینهای پرشمار، شاه آریایی ها و غیر آریایی ها، شاه پارسیان و نژادهای دیگر از جمله عربها، شاه فرمانروایی پارس، یزدگرد سوم ساسانی به عمربن الخطاب خلیفه تازیان ( لقبی که پارسیان به عربها می دهند به معنی سگ شکاری ) به نام اهورا مزدا آفریننده زندگی و خرد تو در نامه ات نوشته ای می خواهی ما را به راه راست هدایت کنی، به راه خدای راستینت، الله اکبر، بدون اینکه هیچگونه آگاهی داشته باشی که ما که هستیم و چه را می پرستیم. این بسیار شگفت انگیز است که تو لقب فرمانروای عربها را برای خودت غصب کرده ای آگاهی و دانش تو نسبت به امور دنیا به همان اندازه عربهای پست و مزخرف گو و سرگردان در بیابانهای عربستان و انسانهای عقب مانده بیابان گرد است. مردک، تو به من پیشنهاد می کنی که خداوند یکتا را بپرستم در حالیکه نمی دانی هزاران سال است که ایرانیان خداوند یکتا را می پرستند و روزی پنج بار به درگاه او نماز می خوانند. هزاران سال است که در ایران، سرزمین فرهنگ و هنر این رویه زندگی روزمره ماست. زمانیکه ما داشتیم مهربانی و کردار نیک را در جهان می پروراندیم و پرچم پندار نیک، گفتار نیک، کردار نیک را در دستهایمان به اهتزاز درمی آوردیم تو و پدران تو داشتند سوسمار میخوردند و دخترانتان را زنده بگور می کردید .شما تازیان که دم از الله می زنید برای آفریده های خدا هیچ ارزشی قائل نیستید ، شما فرزندان خدا را گردن می زنید، اسرای جنگی را می کشید، به زنها تجاوز می کنید، دختران خود را زنده به گور می کنید، به کاروانها شبیخون می زنید، دسته دسته مردم را می کشید، زنان مردم را میدزدید و اموال آنها را سرقت می کنید. قلب شما از سنگ ساخته شده است. ما تمام این اعمال شیطانی را که شما انجام می دهید محکوم می کنیم. حال با اینهمه اعمال قبیح که انجام می دهید چگونه می خواهید به ما درس خداشناسی بدهید؟ تو بمن می گویی از پرستش آتش دست بردارم، ما ایرانیان عشق به خالق و قدرت خلقت او را در نور خورشید و گرمی آتش می بینیم. نور و گرمای خورشید و آتش ما را قادر می سازد که نور حقیقت را ببینیم و قلبهایمان برای نزدیکی به خالق و به همنوع گرم شود. این بما کمک می کند تا با همدیگر مهربانتر باشیم و این نور اهورایی را در اعماق قلبمان روشن می سازد. خدای ما اهورا مزداست و این بسیار شگفت انگیز است که شما تازه او را کشف کرده اید و نام الله را بر روی آن گذارده اید. اما ما و شما در یک سطح و مرتبه نیستیم، ما به همنوع کمک می کنیم ، ما عشق را در میان آدمیان قسمت می کنیم، ما پندار نیک را در بین انسانها ترویج می کنیم، ما هزاران سال است که فرهنگ پیش رفته خود را با احترام به فرهنگ های دیگر بر روی زمین می گسترانیم ، در حالیکه شما به نام الله به سرزمینهای دیگر حمله می کنید، مردم را دسته دسته قتل عام می کنید، قحطی به ارمغان می آورید و ترس و تهی دستی به راه می اندازید، شما اعمال شیطانی را به نام الله انجام می دهید. چه کسی مسئول اینهمه فاجعه است؟ آیا الله به شما دستور داده قتل کنید، غارت کنید و ویران کنید؟ یا اینکه پیروان الله به نام او این کارها را انجام می دهند؟ و یا هردو؟ شما می خواهید عشق به خدا را با نظامی گری و قدرت شمشیر هایتان به مردم یاد بدهید. شما بیابان گردهای وحشی می خواهید به ملت متمدنی مثل ما درس خداشناسی بدهید. ما هزاران سال فرهنگ و تمدن در پشت سر خود داریم، تو بجز نظامی گری، وحشی گری، قتل و جنایت چه چیزی را به ارتش عربها یاد داده ای؟ چه دانش و علمی را به مسلمانان یاد داده ای که حالا اصرار داری به غیر مسلمانان نیز یاد بدهی؟ چه دانش و فرهنگی را از الله ات آموخته ای که اکنون می خواهی به زور به دیگران هم بیاموزی؟ افسوس و ای افسوس ... که ارتش پارسیان ما از ارتش شما شکست خورد و حالا مردم ما مجبورند همان خدای خودشان را این بار با نام الله پرستش کنند و همان پنج بار نماز را بخوانند ولی اینکار با زور شمشیر باید عربی نماز بخوانند چون گویا الله شما فقط عربی می فهمد. من پیشنهاد می کنم که تو و همدستانت به همان بیابانهایی که سابقا عادت داشتید در آن زندگی کنید برگردید. آنها را برگردان به همان جایی که عادت داشتید جلوی آفتاب از گرما بسوزند، به همان زندگی قبیله ای ، به همان سوسمار خوردن ها و شیر شتر نوشیدنها.من تو را نهی نمی کنم از اینکه این دسته های دزد را ( ارتش تازیان) در سرزمین آباد ما رها کنی ، در شهر های متمدن ما و در میان ملت پاکیزه ما. این چهار پایان سنگدل را آزاد مگذار تا مردم ما را قتل عام کنند، زنان و فرزندان ما را بربایند، به زنهای ما تجاوز کنند و دخترانمان را به کنیزی به مکه بفرستند. نگذار این جنایات را به نام الله انجام دهند، به این کارهای جنایتکارانه پایان بده.آریایها بخشنده، خونگرم و مهمان نوازند، انسانهای پاک به هر کجا که بروند تخم دوستی، عشق ، آگاهی و حقیقت را خواهند کاشت بنابراین آنها تو و مردم تو را بخاطر این کارهای جنایتکارانه مجازات نخواهند کرد.من از تو می خواهم که با الله اکبرت در همان بیابانهای عربستان بمانی و به شهرهای آباد و متمدن ما نزدیک نشوی ، بخاطر عقاید ترسناکت و بخاطر خوی وحشی گریت. یزدگرد سوم ساسانی |
||
|
|
|
|
|
فروش یک دوره ۲ جلدی سنجش تکمیلی ویژه آزمون کارشناسی ارشد
در رشته های ژنتیک.میکروبیولوژی.سلولی و ملکولی. ۷۵۰۰۰ تومان |
||
|
|
|
|
|
ميهن در بهت و حيرت، ملت در خشم و نفرت ای کاش مرگ فرا می رسید و این روز ها را نمی دیدم و این اخبار را نمی شنیدم. دیگران را نمی دانم اما اگر .................. |
||
|
|
|
|
|
جریانات گرمایی تصور دریاهای عمیق به عنوان یک محیط دورازدست وبادمای پايین وفشار یالا که فقط باکتریهای مقاوم به فشار وفشار دوست درآن قادربه رشد هستند درست می باشد . البته مطالب شگفت انگیزی هم دراین محیط دیده می شود . تعدادی اجتماعات حیوانی که بااین شرایط سازگاری یافته اند وفعالیت خود را حفظ نموده اند وزندگی آنها متأ خر از میکروارگانیسم هایی است که دراین محیط زندگی می کنند ، وجود دارند . که عمدتاً در نواحی وجوددارند که چشمه های آب گرم در اعماق آب وجود دارند ، ( افزایش نسبی دما در کنار این چشمه ها ) از نظر زمین شناختی این چشمه ها درجاهایی دیده می شوند که در کف اقیانوس ها شکاف هایی وجود دارد ( لبه گسلها ) و مناطقی هستند که مواد بازالتی وماگما بصورت داغ از آنها خارج ودرسطح کف اقیانوس به صورت توده ای ومجزا به آرامی تشکیل می شوند . آب دریاضمن ورودبه این شکافها بسیاری مواد معدنی رادرخودحل میکند وبه صورت چشمه از آن خارج می گردد . درهمین رخواد تشکیل جریانات گرمایی درکف اقیانوسها وعمق دریاها میدهد دونوع عمده از این جریانات شناخته شده اند : الف) جریان گرم : که آبی بادمای c° 23-6 دارند . ب) جریان داغ : که معمولاً مربوط به black smoher ( توده های آتشفشانی در کف به صورت فعال ) بوده وحامی مواد معدنی زیادی است که در نتیجه رسوبات فعال وارد آب می شوند ودرآب حل می گردند . ودر c°380 - 270 ( شکل 26-16) سرعت این دو جریان مشخص گردیده است . برای جریان گرم 2-5. 0 بوده در حالی که جریان داغ سرعتی معادل 2-1 سرعت دارد . حیوانات موجود در جریانات گرمایی بااستفاده از زیردریایی امکان مشاهده ومطالعه این محیط ها وموجوداتی که در آنجا حیات دارد ، ازجمله حیوانات این قبیل محیط ها نوعی کرم لوله ای است که از نظر طول به بیش از 2متر می رسند ، همچنین از حلزونهای درشت و صدف های دوکفه ای نیز دیده شده است . با این وجود این پرسش طرح می شود که در چنین محیطی که از نظر موجودات تولید کننده ففیر می باشد پس این نوع جانوران منابع انرژی خود را درغیاب فتوتروفهای اولیه ازچه راهی تأمین می کنند . تجزیه وتحلیل وآنالیز آب در این محیطها نشان می دهد که مقدار زیادی مواد غیر آلی احیاء شده شامل H2SوMn2+ وهیدروژن ومونواکسید کربن دراین آتها وجوددارند . برخی از جریانات گرمایی هم شامل مقدارکمی H 2S ولی میزان بالایی از NH4 دارند و مواد آلی وجود ندارند . از مطالعات شمیایی ومیکروبی این جریانات به روشنی مشخص می شود که فعالیت این حیوانات وابسته به فعالیت باکتری های کمولیتوتروف است که رشدآنها وابسته به مصرف مواد معدنی وغیر آلی است که از این جریانات به دست می آید. دی اکسید کربن به صورت یون کربنات واسیدکربنیک به میزان فراوانی در آب دریاوجود دارد که توسط کمولیتوتروف ها به مواد آلی تبدیل می شود وبعداً مواد پایه ای برای زنجیره غذایی حیوانات موجود در جریانات گرمایی را تشکیل می دهند . میکروارگانیسم های جریانات گرمایی تعدادزیادی ازکموسیتوتروفهای اکسید کننده گوگرد مثل (( تیوباسلیوس ، تیومیکرواسپیرا ، تیوتریکس وبژیوتوآ )) درون واطراف واین جریانات وجود دارند. نمونه برداری ازمناطق نزدیک وهم جواربااین جریانهای گرمای وکشت آنها ،وجوداین باکتریها رابه اثبات رسانیده اند وبه صورت جزيی تثیت دی اکسیدکربن واکسیداسیون سولفیدهیدروژن و S2032- توسط جعیت های طبیعی این باکتریها نشان داده شده است . برخی جریانات گرمایی حاوی باکتریهای تثبیت کننده ازت ، باکتریهای اکسیدکننده هیدروژن ، باکتریهای اکسیدکننده آهنی ومنگنز وباکتریهای متیلوتروف درمحیط حاوی منواکسید ومتانی که ازاین جریانات واردآب می شود رشدمی کنندمی باشد،که باکتریهای میتلوتروف . جدول 2-16 خلاصه ای ازگیرنده ودهنده های الکترون برای کمولیتوتروف هایی که دراین جریانات نقش آلولوژیکی دارند رانشان می دهد .هرچنداین باکتریهاتوسط این حیوانات خورده می شوند ولی فعالیت اتوتروفی این باکتریهاست که موجب تغذیه این حیوانات می شود . تغذیه حیوانات مجاورجریانات گرمایی باکتریهای کمولیتوتروف مختلفی که درحالت همزیستی باحیوانات این مناطق زندگی میکنند . مثلاًهمین کرمهای لوله ای 2متر دهان ،روده یامخرج ندارند . ولی دارای یک لوله گوارش می باشند که از یک بافت اسفنجی به نام trophosome تشکیل می شود. باوجود اینکه % 50 وزن کرم را trophosome تشکیل می دهد از دانه ها وگرانولهای گوگردی پوشیده شده است ومطالعه میکروسکوپی trophosome نشان می دهد که روی آن تعدادزیادی سلولهای پروکاریوتی وجود دارد که بطورمیانگین تعداد 109×3/7 در هرگرم ازتروفوزوم هااز این سلولها دیده می شود سلولها دیده می شود . سلولها ی مارپیچی بزرگی که روی تروفوزوم دیده می شود ازنظر ساختمانی شبیه باکتری thiovulum می باشد که یک باکتری اکسید کننده گوگرد است . بافت تروفوزم شامل آنزیمی به به نام rhodarase است که این آنزیم قادر است S2032 را به گوگرد وسولفات تبدیل کند . همچنین آنزیمهای دیگری مثل rubisco ودیگرآنزیمهای چرخه کلوینی که بیشتر موجوداست اتوتروف برای تثبیت co2 نیاز دارند ، به صورت درون سلولی درتروفوزوم وجوددارد . باکتریها یکمولیتوتروف موادغذایی کرمهای لوله ای راباتغذیه خودتولید می کنند ودیگرحیوانات هم ازمواددفعی این موجودات وسلولهای مرده که بصورت همزیست زندگی می کنند بدست می آورند . دود قرمزروشنی شکل ب در 30-16 ) در تروفوزوم دررگهای خونی به میزان زیادی یافت می شود ودرانتقال اکسیژن وسولفیدهیدروژن به باکتریهای کمولیتوتروف نقش دارد. چنین حالتی درصدف ها و حلزونهای بزرگ دراین مناطق نیزدیده می شود که به حالت همزیستی باباکتریهای اکسیدکننده گوگرد به حیات خود ادامه می دهند . استفاده از توالی یابی اسیدهای نوکلئید و آنالیزفینولوژیک نشان داده که هریک ازحیوانات این مناطق بادسته ای خاص ازیاکتریهای موجود به صورت همزیست زندگی می کنند . مطالعات بیشتر درموردکرم های لوله ای نشان داده که این موجودات دارای هموگلوبین های محلول غیرمعمول می باشند که با h2s واکسیژن به خوبی پیوندحاصل می کنند . وهردوماده را درتروفوزوم به باکتریهای کمولیتوتروف انتقال میدهند . که این کار باعث عدم تجمع h2s وجلوگیری از مسمومیت کرمها می شود . میزان co2 درخون کرمها بالاست ( mm30-20) واین میزان به درون تروفوزوم آزاد شده وبه عنوان منبع کربن عمل میکند ( برای باکتریهای کمولیتوتروف ) بعلاوه آنالیز ایزوتوپهای پایدارگوگرد که درباکتریهای همزیست یافت شده نشان می دهد که میزان قابل توجهی متفاوت ازسولفات آب دریاست ، واین موضوع گواهی برجذب سولفید توسط کرم لوله ای می باشد یک ارتباط بین تغذیه حیوانات ودیگر گروهای فیزیولوژیک کمولیتوتروف پیشنهاد شده است : باکتریها همزیست متانوتروف یک نقش مهم درتغذیه حیوانات این مناطق وجریانات گرمایی دارند ( خلیج مکزیک ) در اینجا این باکتریها با اکسید اسیون ch4 به عنوان منبع کربن عمل کرده ودر تأمین غذایی حیوانات نقش پشتیبانی دارند . دیگرکمولیتوتروف های اکسیدکننده آهن ،h2 ومنگنز به صورت همزیست نبوده ولی دارای زندگی آزاد می باشند وباعث احیای مواد ی میشوند که ازاین جریانات خارج می شود ، بااین حال این باکتریها می تواند به عنوان تولید کننده های اولیه در اکوسیستم جریانات گرمایی باشند . آبهای فوق گرم وتپه های دریایی فشار بالا دراعماق زیاددردریاهای عمیق برفعالیت فیزیولژیک آب تأثیر می گزارد . درعمق 2600متری آب دردمای c450 به جوش می آید دراغلب محیط های فوق گرم (ولی غیرجوش ) جریانات گرمایی که دارای دمایی درحدود 380-270 درجه سانتیگراد می باشند وازنظرتئوری برای باکتریهای گرمادوست افراطی به عنوان یک محیط اکولوژیکی مصرفی می شوند . دراین جریانات فوق گرم سولفیدهای فلزی بخصوص سولفید آهن وجوددارد که به سرعت درآب دریا سرد می شوند . ورسوب تشکیل می دهند . این رسوبات درمحل خروج بصورت برج ارتفاع پیداکرده ودودکش هایی راتشکیل می دهند ( خروج گدازه های داغ ازاعماق ) دورازذهن نیست که در این نواحی فقط باکتریهای گرما دوست وفوق گرما دوست قادربه حیات باشند . دراین مناطق جریانات آبی فوق گرم درآب سرداقیانوسها سردشدند ومحیطی برای این باکتریها فراهم می شود ، به طورمثال برروی این دود کش ها باکتریهای گرمادوست افراطی مثل methanopyrus که یک باکتری تولیدکننده گاز متان است و با اکسید اسیون h2 متان تولید می کنند وجوددارد واز نظر تکامل این باکتری بسیار جالب توجه است . بااستفاده ازتکنولوژی fish حضور باکتریها وآرکی باکتریها روی دیواره این برجهای دود کش مانند به اثبات رسیده است . علاوه بردودکش تپه های فعال دریای نیز شناخته شده اند این تپه هایزیردریایی آتشفشانی که ابتدا برروی صفحات تکنونیکی اقیانوس آرام قرارداشتند ،موادمعدنی مزیک را به داخل آب آزاد می کردند، پس نه تنهاازدودکش هابلکه ازاین تپه ها ی آتشفشانی درحال انفجار وفواران نیزموادزیادی یه درون آب دریا واقیانوس آزادمی کنند که در نتیجه اطراف اینها هم پروکاریوت های متفاوتی زندگی میکنند . متازوآماوجریانات آتشفشانی : دراین جریانات متازوآما به ویژه یک نوع دسته ای به نام alvinella زندگی می کنند که تحت عنوان کرم پمپی نیز شناخته می شود وروی سطح خارجی دودکش های آتشفشانی رشدمی کند وجالب اینجا که به شدت نسبت به آب داغ مقاوم می باشد . اندازه گیری ها نشان داده که دمای درونی این کرم بالغ برc৹80 است واین موجود مقاوم ترین موجودی شناخته است که به گرما تحمل دارد . سطح این کرم از باکتری های رشته ای همزیست پوشیده شده است که کمولیتوتروف می باشند اگرچه این باکتریهای همزیست خارجی مثل باکتریها ی همزیست روی صدف وحلزون وکرم لوله ای نیستند . ازنظرتغذیه ای ) ولی برای کرم پمپی منابع غذایی خوبی می باشند محققان دریافتند که این کرم ها باخروج ازلوله خود به طور مستقیم از کلنیها ی اطراف کرم تغذیه می کنند . مکانیسم مقاومت به حرارت درکرم پمپی به درستی مشخص شده است . ولی حضورزیاد این قبیل حیوانات مقاوم به حرارت نشان می دهد که ساختار سلولهای یوکاریونی بیش از آنچه فکر می شود به حرارت مقاوم می باشد . پیشنهادی که ارائه شده است این است که یوکاریوتهای مقاوم به حرارت از نظر تکاملی . برآوردحیات میکروبی دردمای بالادرطبیعت تلاش برای تشریح حیات ونقش محدودکنندگی دمابه ارزیابی رشد باکتریای روی برجهای فعال آتشفشانی درکف اقیانوسها برمی گردد . به این منظور باظروفی ازجنس تیتانیوم از این مناطق نمونه گیری وجهت مطالعه وچگونگی کلنیزه شدن آنها مورد بررسی قرارمی گیرد .این باکتریها رادردمای 125 تا 140 درجه قادریم جداسازی کنیم . سطوح بادمای بالا مثل 200درجه بالاتر هیچ میکروارگانیسمی رانشان نمی دهد . تابه حال این باکتری های که جداشده رانتوانسته اند روی محیط های مصنوعی کشت دهند . مدارکی دال بر احیا بیولوژیک سولفات در آبهای داغ دریا ورسوبات در دمای C 130یافت شده است مجوعاً این نتایج می گویند که حد دمای بالا برای زندگی میکروبی مثل دمای بالاتراز دمای رشد باکتریهای ترموفیل است مثل pyrolobusfumarii که دردمای 113 رشد کرده ولی احتمالاً تازیر c150 رشد می کند . بررسی مفاهیم : منافذ وجریانات گرمای پدیده است که براثر فعالیت آتشفشانی درعق دریاها رخ می دهد ومیزان زیادی مواد معدنی که به عنوان منابع انرژی برای استفاده باکتریهای کمولیتو تروف مورد مصرف قرارمی گیرد ، رابه آب دریا وارد می کند . این با کتریها باتثیت co2 موادآلی بوجودمی آوردند واتوتروف های اعماق زیاد آب های داغ می باشند . ودر ابتدای زنجیره ساده غذایی حیوانات این مناطق قرا رمی گیرند وبیشتر از فتوتروف ها ازنظر تولید انرژی دراین مناطق اهمیت دارند . · چگونگی تمایز درجریان black smocker وجریانات گرمای گرم راازنظر فیزیکی وشیمیایی تشریح کنید ؟ · کرم های لوله ای غول پیکر چگونه تغذیه می کنند ؟ · دلیل اینکه موجودات زنده می توانند دردمای بیش از c 100 رشد کنند چیست ؟ |
||
|
|
|
|
|
در حال حاضر ۳ سایت فعال ایرانی در زمینه میکروب شناسی مشغول به کار هستند که یکی از این سایت ها به زبان انگلیسی نیز فعال است.
"میکروب شناسی" یکی از این سایت ها است که به دو زبان فارسی و انگلیسی اطلاعاتی را بر روی اینترنت قرار می دهد. آدرس اینترنتی این سایت WWW.alborzicmrc.org و وابسته به مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی استاد البرزی است. |
||
|
|
|
|
|
در حال حاضر ۱۴سایت ایرانی در زمینه "زیست شناسی و زیست فناوری" فعالیت می کنند که تعدادی از آنها به زبان انگلیسی هستند.
یکی از این سایت ها مربوط به پژوهشکده بیوتکنولوژی است که دارای اطلاعاتی در مورد پروژه ها، تحقیقات خدمات و معرفی بخش ها اطلاعات را ارایه داده است و به آدرس اینترنتی WWW.avesina.org است.
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
مقدمه :
پروتئین رتینال باکتریورودوپسین در واقع پروتئین فتوسنتزی آرکائون
هالوباکتریوسالیناروم می باشد .این مورد می تواند انرژی نور سبز ( 500 تا 650 nm و ماکزیم 568nm ) را به پروتون الکتروشیمیایی تبدیل کند که برای تولید ATP توسط سنتز ATP مورد استفاده قرار می گیرد . این مسئله به عنوان یک پمپ پروتون با نور عمل می کند که باعث انتقال پروتون ها از سلول شده وکاتالیز وکتوریال را نمونه سازی می کند و مراحل آن را سهولت می دهد . مبحث باکترورودوپسین در واقع همه توجهات را به سوی خود جلب کرده و بصورت برنامه ای برای پروتئین های غشائی در انتقالات خاص در آمده است . ساختار آن و عملکرد آن در جزئیات زیاد آنالیز شده و تکنیکهای تجربی زیاد و متفاوتی را در بر گرفته و از بهترین نمونه های قابل فهم در کاتالیز وکتوریال محسوب می شود ... تغییر رنگ هدف نوری قابل برگشتی تمیز صورت می گیرد که کاربرد بیوتکنیکی باکتریورودوپسین را توسعه می دهد و کاربرد آن را در ثبت اطلاعات بحدی افزایش می دهد .
تشریح بیشتر در اینجا بر اساس بررسی مقاله های هاپت ، تیوتر و آستریت در سال 1999 می باشد .
ساختار و عملکرد باکتریورودوپسین :
باکتریورودوپسین مثل همۀ پروتئین های رتینال از خانواده هالوباکتریوم ، در واقع به 7 مارپیچ انتقال غشائی توپولوژی تا می خورد که با حلقه های بین الارتباطی کمی همراه است . مارپیچ های تحت نام A,G به صورت کمانی شکل قرار گرفته اند و اطراف مولکول ریتنال را احاطه کرده اند که از طریق پایۀ شیف Shiff با لیزین روی مارپیچ G پیوند کووالانسی برقرار نموده است .
بخش عرضی bR با بقایای مهم برای انتقال پروتون و مسیر احتمالی پروتون در شکل (1) نشان داده شده است .
ساختار (D3 ) از طریق پایانه داده های PDB قابل دسترس می باشد که ورودی BRR محسوب می شود .
شکل 2 نشانگر مدل توالی می باشد . رتینال می تواند سیتوپلاسما را از نیمه کانال برون سلولی که بواسطۀ آمینواسیدها جهت انتقال پروتون توسط BR متصل شده اند جدا کنند ( خصوصاً 96-Asp برای انتقال در سیتوپلاسما و 85-Asp برای کانال نیمه بیرون سلولی ) . پایه شیف که بین رتینال و 216-Lys برقرار است در مرکز این کانال واقع شده است . برای مجاز کردن انتقال پروتون وکتوریال دی ورپیروتوناسیون پایۀ شیف ، بایستی از جهات مختلف غشاء صورت گیرد . قابلیت دسترس بودن پایۀ شیف برای 96-Asp و 85-Asp بایستی طی سیکل کاتالیت سویچ شوند . هندسۀ رتینال و پایۀ پروتوناسیون مربوط به پایۀ شیف و واکنش با الکترواستاتیک موجود با بارهای اطراف آن ( 85-Asp و 212-Asp و82-Arg ) و دو قطبی ها هم با حداکثر جذب برای عملکرد بیولوژیکی همراه هستند .
غشای ارغوانی purple :
سطح سالیناروم هالوباکتریوم شامل مسیرهای غشایی است که غشای ارغوانی یا پریل نامیده می شود ، نسبت پروتئین به لیپید معادل 75 به 25 است . تنها پروتئین موجود در غشای پریل در واقع br است که یک کریستال دو بعدی هگزاتولی را شکل می دهد که شامل تریم های باکتریورودوپسین می باشد . غشای ارغوانی را میتوان به سادگی ایزوله نمود و اجازه داد تا تولید جرم باکتریورودوپسین برای کاربرد بیوتکنیکال طبق موارد لازم مورد استفاده قرار میگیرد .
سیکل کاتالیتی باکتریورودوپسین :
جذب فوتون بواسطۀ باکتریورودوپسین در واقع یک سیکل کاتالیتی را آغاز می کند که به انتقال پروتون از سلول منجر می شود . چندین واسطۀ در فوتوسیکل توسط تکنیکهای اسپکتروسکوپی شناسایی شده اند .
بواسطۀ کاربرد تکنیکهای بیوفیزیکی ، طبیعت اتمی و تغییرات در هر مرحله از این سیکل شناسایی شده و با تابع انتقالی ارتباط دارد .این سیکل را می توان بطور رسمی بر حسب 6 مرحلۀ ایزومریزاسیون (I) ، انتقال یون (T ) و تغییر قابل دسترس تشریح شود ( سوئیچ S) .
رتینال فتوایزومرانیزهای اولیه از یک All-trans به یک شکل cis-13 حرکت می کنند که با انتقال پروتون از پایۀ Schiff به اکسپتورپروتون 85-Asp همراه است . برای اعمال و کتوریالیتی ، در واقع می بینیم که ریپروتوناسیون پایۀ شیف از 85-Asp بایستی جدا شود . بنابراین دستیابی آن از بخش برون سلولی به درون سلولی قابل انتقال می باشد . بنابراین پایۀ شیف بعداً از 96-Asp در کانال سیتوپلاسمی ، ریپروتونات می شود . بعد از ریپروتوناسیون 96-Asp از سطح سیتوپلاسمی در واقع ایزومرایزهای رتینال بطور حرارتی صورت می گیرد و قابلیت دسترس بودن پایۀ شیف به بخش برون سلولی منتقل می شود که باعث برقراری مجدد وضعیت اولیه می شود . این مراحل نشانگر تعداد حداقل مراحل لازم برای توجیح کاتالیزهای وکتوریال در باکتریورودوپسین نوع وحشی می باشد .
مرحلۀ سیکل کاتالیتی :
تغییرات ساختاری دینامیکی که در کروموفور و پروتئین در طی سیکل واکنشی حاصله از نور را می توان یا بطور مستقیم بواسطۀ تکنیکهای اسپکتروسکوپی حل شدۀ زمانی ( اسپکتروسکولپی لیزری آلترافاست ، فتولیزنوری ، ESR ( اسپکتروسکوپی ، اسپکتروسکوپی FTIR ) و یا بواسطۀ وضعیت های متوسطه دمانی ، تعیین ساختار های توسط متدهای استاتیکی ( اسپکتروسکوپی NMR و میکروسکوپ الکترونی و اسکاترینگ نوترون ) و همچنین مقایسه با وضعیت زمینی تعیین نمود .
واکنش اولیه فتوایزمریزاسیون رتینال از all-trans به 13-cis :
در پروسۀ استریوسلکتیو ، در واقع رتینال all-trans بصورت رتینال 13-cis تحت فتوایزومریزاسیون قرار میگیرد . این پروسه از نظر زمانی حل شده و به چند فمتوسکند تبدیل می شود . در عرض 500 fs ، همۀ all-strans و ایزومرهای رتینال به رتینال 13-cis تبدیل می شوند و باعث 600 j می شوند که در 5ps دیگر قابل تبدیل به 590k می باشد .
از 590k به 550L میانی :
واسطۀ 590k در حقیقت قابل تبدیل به 550L در عرض µs2 میباشد . واکنش اتصالی هیدروژن در کانال برون سلولی میان پایۀ شیف پروتونات و 85Asp محکم شده که یک مولکول آب را در بر گرفته است.
اولین مرحلۀ ترانسلوکیشن پروتن : از 550L به 41M (EC) :
وضعیت M ، از وضعیت L در عرض چند میکروثانیه حاصل می شود . این انتقال در واقع انتقال پروتون از پایۀ شیف به 85-Asp در میانۀ کانال برون سلولی را در بر می گیرد .
اولین واکنش انتقالی قابلیت دسترس از محل برون سلول به محل سیتوپلاسمی :
M 410 (CP)به M410(EC)
برای مجاز کردن انتقال وکتوریال پروتون ، در واقع بایستی دی و رپروتوناسیون شیف از جهات مختلف غشاء اتفاق افتند . این سویچ و قابلیت دسترسی در واقع در سطح میانی M . M 410 (CP)به M410(EC)رخ می دهد ، بنابر این واسطۀ تشریح شده "M " در حقیقت به دو یا چند میانۀ مختلف تقسیم می شود که همگی به رنگ زرد هستند .
مرحله انتقال ری پروتوناسیون پایۀ شیف از 96-Asp در سیتوپلاسمیک نمیۀ کانال در واقع طی انتقال از (EC)410 mبه میانۀ 560N در عرض میلی ثانیه صورت می گیرد . (پروتوناسیون 96-Asp تا بواسطۀ پروتون از سیتوپلاسم ) طی طول عمر میانی 560N صورت می گیرد . بایستی توجه نمود که عملکردهای 96-Asp به عنوان انبار پروتون برای دی پروتون های پیایۀ شیف ارائه می شود . بنابراین پروتون مستقیماً از سیتوپلاسم ریشه نمی گیرد .
این جزئیات مشخص می کند که پدیدۀ پازنینگ ارائه می شود که میزان انتقال این ترانسپورتر پروتون به PH وابسته نیست .
ترموایزومراسیون رتینال ازcis-13تا all-trans : 560N تا 640O :
انتقال 560N تا 640O میانی نرمال cis_13 به ایزومریزاسیون all-trans رتینال در محیط 96-Asp پروتوناته شده و 85_Asp پروتوناته تبدیل می شود .
واکنش سویچ قابلیت در دسترسی ثانویه از سیتوپلاسم به برون سلول : (640C)به BR :
دی پروتوناسیون 85_Asp در واقع سیکل کاتالیتی را تکمیل می سازد . سویچ کردن قابلیت دسترسی برگشت پایۀ درون سلولی از برون سلول به درون سلول در عرض 5 cams رخ می دهد و باعث ذخیره شدن وضعیت آغازین می شود .
موتاژن های هدایت شدۀ سایت باکتریورودوپسین :
ابزار مهمی برای این مطالعات و همچنین برای بررسي هاي اسپکتروسکوپیکی که روی ساختار و دینامیک انجام می گیرد و در واقع امکان تولید پروتئین های اصلاحی که بواسطه موتاژن های هدایتی سایت و ارائه زياد همولوگ هاي تولید شده را فراهم می سازد .
بواسطۀ این متد نقش آمینواسید ها و بقایای مربوط به مکانیسم انتقالی را می توان مورد بررسی قرار داد و یا اینکه مولکول های گزارشگر را می توان در برخی موارد در موقعیت ها ارائه نمود . در رابطه با فوتوسیکل ها و انتقال پروتون ، چندین موتاسیون در ارتباط هستند و احتمالاً باعث گیر افتادن واسطه های سیکل کاتالیتی می شود . درگیری مستقیم 85-Asp و 96-Asp در انتقال پروتون بواسطۀ آنالیزموتاسیون ها مشخص شده است .
باکتریورودوپسین به عنوان ماده ای برای ثبت اطلاعات اپتیکال :
کاربرد بيو تكنيكي بر اساس تغییر رنگ بین زرد و ارغوانی در واقع اساس کاربرد باکتریورودوپسین برای ثبت اطلاعات اپتیکال محسوب می شود . تکنیک مذبور طوری پیشرفت کرده که می تواند به عنوان یک عامل ایمنی روی چیپ کارد Chipcard مورد استفاده قرار گیرد . برای جزئیات بیشتر به صفحۀ باکتریورودوپسین در وب سایت prof.n.hanpp مراجعه نمائید .
نانوتکنولوژی بکار رفته جهت آنالیز باکتریورودوپسین :
اسپکتروسکوپی نیروی اتمی در واقع برای بررسی مولکولها و جابجایی مولکولهای باکتریورودوپسین در غشای ارغوانی بکار برده شده که این مسئله باعث ارزیابی نیروی لازم برای کشیدن مارپیچ های منفرد به خارج از غشا می شود . یکی از پیش نیازهای مولکولی برای این آزمایشات درواقع ارائۀ بقايايي Cys به باکترورودوپسین بواسطۀ موتاژن های هدایتی سایت می باشد .
|
||
|
|
|
|
|
میکرو ارگانیسم ها موجودات ریز ذره بینی مانند : باکتری ها ، ویروس ها ، قارچ های میکروسکوپی و پروتوزوئرها هستند که باچشم غیر مسلح دیده نمی شوند . علم میکروبیولوژی که گرایشی از زیست شناسی است به بررسی و مطالعه میکرو ارگانیسم ها می پردازد . در این علم ارتباط میکرو ارگانیسم ها با خودشان و همچنین با موجودات عالیتر مانند انسان ، حیوانات و گیاهان بررسی می شود . علم میکروبیولوژی گرایش های مختلفی دارند که عبارتند از : میکروبیولوژی پزشکی ، میکروبیولوژی غذایی و میکروبیولوژی صنعتی . محقق این گرایش از یک سو می تواند به بررسی کاربرد سلاح های میکروبی و راه های پیشگیری از این سلاح ها بپردازد و از سوی دیگر می تواند در کارخانه های عطر سازی مشغول باشد . میکرو بیولوژی پایه و اساس بسیاری از علوم از قبیل : بیوشیمی ، بیوتکنولوژی ، ژنتیک و پزشکی است . یکی از کاربردهای گرایش میکروبیولوژی در آزمایشگاه های تشخیص طبی است . میکروبیولوژی در تشخیص بیماری نیز اهمیت بسیار زیادی دارد . در موادغذایی و تولید موادغذایی مختلف نیز اثر میکرو ارگانیزم ها بسیار قابل توجه است ، همچنین گرایش میکروبیولوژی در کشاورزی بطور بسیار وسیعی در تشخیص آفات گیاهی ، مبارزه با افات گیاهی و ایجاد مقاومت گیاهی مورد استفاده قرار می گیرد . در صنایع و معادن نیز برای استخراج فلزات سنگین و در تصفیه در گوگرد زدایی از نفت مورد استفاده قرار می گیرد . در محافظت از محیط زیست ، تصفیه فاضلاب ها و مبارزه بیولوژیکی با عفونت ها و آلودگی های فاضلابی مورد استفاده قرار می گیرد و آب سالم و در حقیقت بدون آلودگی تحویل می دهد . حتی در صنعت نساجی نیز این علم به یاری بشر آمده است و به تازگی در صنعت نساجی از میکرو ارگانیسم ها برای تثبیت نشاسته و آهار دادن پارچه استفاده می شود .
موقعیت شغلی در ایران: کارشناسان میکروبیولوژی در پژوهشگاه نفت برای تحقیق بر روی میکروب های نفت خوار یا گوگرد زدایی ، در بخش صنایع غذایی در کارخانه های کنسرو سازی و کمپوت سازی و در صنایع بهداشتی مشغول به کار هستند. تهیه لوازم آزمایشگاهی مورد نیاز در این گرایش یکی از شغل هایی است که بعضی جذب آن میشوند. مؤسسه استاندارد یا آزمایشگاه های کارخانجات تهیه مواد بهداشتی و غذایی برای تشخیص کیفیت و سلامت این مواد از نظر عدم آلودگی میکروبی ، مراکز تهیه مواد دارویی مانند تهیه آنتی بیوتیک و بالاخره کارخانجات تهیه اسیدها مانند اسید بوتریک و اسید استیک و حلال ها مانند الکل و استون و مراکز تهیه واکسن مانند مؤسسه رازی و انستیتوپاستور ایران نیز می توانند مراکز جذب فارغ التحصیلان این گرایش باشند.
دروس تخصصی گرایش میکروبیولوژی: زیست شناسی سلولی ، زیست شناسی مولکولی ، ژنتیک ، میکروبیولوژی ، ویروس شناسی ، زیست شناسی پرتوی ، بیوشیمی ، بیوفیزیک ، ایمونولوژی ، باکتری شناسی ، میکروبیولوژی محیطی ، قارچ شناسی ، پرتوزیو لوژی. (بسیاری از درس های این گرایش همراه با آزمایشگاه است. |
||